Klíčový rozdíl mezi kyselinou jablečnou a kyselinou maleinovou spočívá v tom, že kyselina jablečná je nasycená dikarboxylová kyselina, zatímco kyselina maleinová je nenasycená dikarboxylová kyselina.
Kyselina jablečná a kyselina maleinová jsou dikarboxylové kyseliny. To znamená, že tyto sloučeniny obsahují dvě karboxylové skupiny (-COOH) ve stejné molekule připojené ke dvěma různým atomům uhlíku. Rozdíl mezi kyselinou jablečnou a kyselinou maleinovou spočívá v nasycení (přítomnost dvojných nebo trojných vazeb znamená nenasycenost). Protože kyselina maleinová má dvojnou vazbu mezi dvěma atomy uhlíku, jedná se o nenasycenou sloučeninu. Ale mezi atomy uhlíku kyseliny jablečné neexistují žádné dvojné nebo trojné vazby.