Klíčovým rozdílem mezi cytochromem a fytochromem je, že cytochrom je hemový protein přenosu elektronů, který se podílí na aerobním dýchání. Mezitím je fytochrom fotoreceptorový protein, který je citlivý na červené a daleko červené světlo viditelného spektra.
Živé organismy mají různé typy pigmentů. Některé jsou pigmenty absorbující světlo, jiné pigmenty dýchací. Cytochrom je metaloprotein, který funguje jako nosič elektronů v aerobním dýchání. Mezitím je fytochrom fotoreceptor, který absorbuje červené a daleko červené světlo z viditelného spektra. Ve srovnání s cytochromem jsou fytochromy důležité v mnoha aspektech vývoje rostlin.
