Klíčovým rozdílem mezi F plazmidem a R plazmidem je to, že F plazmid je extrachromozomální DNA, která obsahuje geny kódující faktor plodnosti. Mezitím je R plazmid extrachromozomální DNA, která obsahuje geny kódující rezistenci proti antibiotikům.
Plazmid je malá kruhová dvouvláknová DNA přítomná v bakteriích. Jsou to extrachromozomální DNA a jsou schopné samoreplikace. Nesou geny nezbytné pro jejich vlastní replikaci a údržbu. Kromě toho, že obsahují geny nezbytné pro vlastní replikaci, obsahují plazmidy také několik dalších nezbytných genů pro kódování zvláštních znaků, jako je rezistence na antibiotika, degradace makromolekul, tolerance vůči těžkým kovům, produkce bakteriocinů, přenos genů atd. prospěšné pro bakterie.
Kromě toho existuje velké množství plazmidů. R plazmidy a F plazmidy jsou dva typy mezi nimi. F plazmid je plazmid plodnosti schopný konjugace a produkce sexuálních pili. R plazmid je rezistenční plazmid, který je schopen poskytovat rezistenci proti antibiotikům a určitým inhibitorům bakteriálního růstu.