Klíčový rozdíl - Ti vs Ri Plasmid
Agrobacterium je bakteriální rod, který způsobuje u dvouděložných rostlin několik nemocí, včetně onemocnění korunní žluče a onemocnění chlupatých kořenů. Tato dvě onemocnění jsou kódována geny umístěnými v plazmidech (nechromozomální DNA) bakterií. Bakteriální druh Agrobacterium tumerfaciens nese nádor indukující plazmid (Ti plazmid), který je odpovědný za onemocnění korunní žlázy v rostlinách. Agrobacterium rhizogenes je další bakterie, která obsahuje plazmid indukující kořeny (Ri plazmid) odpovědný za onemocnění vlasových kořenů v rostlinách. Ti a Ri plazmidy jsou patogenní plazmidy jedinečné pro tento bakteriální rod. Klíčovým rozdílem mezi plazmidem Ti a Ri je to, že plazmid Ti je kódován geny odpovědnými za způsobení onemocnění korunní žíly, zatímco plazmid Ri je kódován geny pro onemocnění vlasových kořenů v rostlinách. Tyto patogenní plazmidy obsahují genové shluky odpovědné za replikaci DNA, virulenci, T-DNA, využití opinu a konjugaci. Během infekce Agrobacterium exciduje svou oblast T-DNA (přenos DNA) plazmidu a integruje se s rostlinným genomem, aby způsobil onemocnění. Tuto schopnost využívají molekulární biologové k zavedení důležitých genů do rostlin v genetickém inženýrství. Agrobacterium je tedy považováno za důležitý nástroj v biotechnologiích a molekulární biologii pro zavádění chimérické DNA do různých druhů rostlin. Tuto schopnost využívají molekulární biologové k zavedení důležitých genů do rostlin v genetickém inženýrství. Agrobacterium je tedy považováno za důležitý nástroj v biotechnologiích a molekulární biologii pro zavádění chimérické DNA do různých druhů rostlin. Tuto schopnost využívají molekulární biologové k zavedení důležitých genů do rostlin v genetickém inženýrství. Agrobacterium je tedy považováno za důležitý nástroj v biotechnologiích a molekulární biologii pro zavádění chimérické DNA do různých druhů rostlin.
OBSAH
1. Přehled a hlavní rozdíl
2. Co je Ti plazmid
3. Co je Ri plazmid
4. Porovnání vedle sebe - Ti vs. Ri plazmid
5. Shrnutí
Co je Ti Plasmid?
Plazmid indukující nádory (Ti plasmid) je větší plazmid, který je uchováván Agrobacterium tumerfaciens a způsobuje onemocnění korunní žlázy u široké škály dvouděložných rostlin. Název onemocnění korunní žlučníku se používá kvůli tvorbě velkých nádorových otoků (hálek) na koruně rostlin nad povrchem půdy v důsledku nadměrné produkce rostlinných hormonů auxinu a cytokininů A. tumerfaciens. Oblast T-DNA obsahuje geny indukující nádor. Agrobacterium tumerfaciens vstupuje do rostlin poškozenými rostlinnými tkáněmi, zejména ranami, a přenáší svou část plazmidové DNA (T-DNA) spolu s geny způsobujícími chorobu do rostlinných buněk. Tato T-DNA se poté integruje do genomu rostlinné buňky a přepíše se. Exprese genů způsobuje tvorbu nádorů a související změny v buněčném metabolismu. Onemocnění korunní žlázy nezpůsobuje vážné poškození starších rostlin. Snižuje to však kvalitu mateřských rostlin.
Kvůli tomuto jedinečnému způsobu infekce je A. tumerfaciens široce používán jako nástroj v genetickém inženýrství pro produkci transgenních rostlin. Geny indukující nádor jsou potlačeny a požadované geny, jako jsou geny rezistentní na insekticid a geny rezistentní na herbicid, jsou vloženy nebo rekombinovány do Ti plazmidu pomocí technologie rekombinantní DNA a použity v šlechtitelských programech rostlin. Když se T-DNA přenáší po infekci A. tumerfaciens na rostliny, získávají rostliny účinky požadovaných genů přirozeně. Proto může být jakákoli cizí DNA vložená do T-DNA integrována do genomů rostlinných buněk pomocí procesu přirozené infekce této bakterie.
Obrázek 01: Ti plazmid A. tumerfaciens
Co je Ri Plasmid?
Kořen indukující plazmid (Ri Plasmid) je plazmid nesoucí bakterií A. rhizogenes. Ri plazmid je zodpovědný za onemocnění zvané choroba vlasových kořenů u dvouděložných rostlin. Infekce A. rhizogenes způsobuje rozsáhlou tvorbu náhodných kořenů v místě infekce nebo v jeho blízkosti. Geny indukující chlupatý kořen se nacházejí v oblasti T-DNA plazmidu Ri. Ri plazmid je větší plazmid podobný Ti plazmidu. A. rhizogenes je také schopen přenést oblast T-DNA RI plazmidu do rostlinných buněk a integrovat se s genomem rostlinné buňky, aby získal transkripce pomocí mechanismu rostlinných buněk k vyvolání onemocnění. Ri plasmidy tedy také slouží jako důležité vektory v genetickém inženýrství rostlin.
Jaký je rozdíl mezi Ti a Ri Plasmid?
Rozdílný článek uprostřed před tabulkou
Ti vs Ri Plasmid |
|
| Ti plazmid je kruhový a větší plazmid ukrytý A. tumerfaciens | Ri plazmid je kruhový a větší plazmid ukrytý A. rhizogenes |
| Choroba | |
| Ti plazmid kóduje geny pro onemocnění korunní žlázy v rostlinách | Ri plazmid kóduje geny pro onemocnění vlasových kořenů u dvouděložných rostlin. |
Shrnutí - Plasmidy Ti vs Ri
Ti a Ri plazmidy jsou patogenní plazmidy, které ukrývají A. tumerfaciencs a A. rhizogenes. Ti plazmid má geny vyvolávající nádory, které způsobují onemocnění korunní žlázy v rostlinách. Ri plazmid má kořen indukující geny, které způsobují onemocnění vlasových kořenů v rostlinách. To je hlavní rozdíl mezi Ti a Ri plazmidy. Tyto plazmidy mohou být použity jako vektory v genetickém inženýrství rostlin díky jejich přirozené schopnosti přenášet část jejich plazmidové DNA do hostitelského genomu. Obsahují genové shluky a mají velikost přibližně 200 kbp. Každý plazmid obsahuje jedinečné geny.
