Klíčovým rozdílem mezi oligopeptidem a polypeptidem je, že oligopeptidy obsahují několik aminokyselinových zbytků, zatímco polypeptidy obsahují velké množství aminokyselinových zbytků.
Pojmy oligopeptidy a polypeptidy spadají do kategorie proteinů. Peptidy jsou krátké řetězce aminokyselin. Aminokyseliny se navzájem vážou prostřednictvím peptidových vazeb. Proto můžeme tyto peptidy kategorizovat podle počtu aminokyselin přítomných v těchto peptidech. Např. Dipeptidy, tripeptidy, tetrapeptidy, oligopeptidy a polypeptidy.
