Klíčovým rozdílem mezi celkovým počtem buněk a počtem životaschopných buněk je, že celkový počet buněk odhaduje všechny buňky včetně živých i mrtvých mikrobiálních buněk ve vzorku, zatímco počet životaschopných buněk odhaduje pouze živé mikrobiální buňky ve vzorku.
Počítání počtu organismů v populaci je považováno za nezbytné pro většinu experimentálních prací. Proto se snažíme analyzovat počet mikrobů ve vzorku pomocí přímých a nepřímých metod. Přímé měření zahrnuje metody, které přímo počítají počet buněk. Nepřímé měření zahrnuje měření některých parametrů, které mohou souviset s počtem buněk, jako je hustota buněk, suchá hmotnost atd. Některé metody kvantifikují pouze živé mikrobiální buňky ve vzorku. Jednou z takových metod je počet životaschopných buněk. Přímé mikroskopické počty kvantifikují všechny buňky ve známém objemu média / vzorku pomocí mikroskopu. Proto počítá živé i mrtvé buňky. Je to typ celkového počtu buněk.
