Klíčovým rozdílem mezi transaldolázou a transketolázou je jejich funkce. Transaldolasa katalyzuje přeměnu sedoheptulózy 7-fosfátu a glyceraldehydů 3-fosfátu na erytrosy 4-fosfát a fruktózu 6-fosfát, zatímco transketolasa katalyzuje přeměnu xylulózy 5-fosfátu a ribózy 5-fosfátu na glyceraldehyd 3-fosfát a sedoheptulosu 7-fosfát.
Pentóza-fosfátová cesta je metabolická cesta, která probíhá paralelně s glykolýzou. Skládá se ze dvou odlišných cest. V pentózo-fosfátové dráze se NADPH generuje v oxidační fázi, zatímco pentózové cukry se generují v neoxidační fázi. Kromě pentóz a NADPH tato cesta generuje 5-fosfát ribózy, který je předchůdcem syntézy nukleotidů. Transaldolasa a transketolasa jsou dva enzymy podílející se na neoxidační fázi pentózo-fosfátové dráhy.