Klíčovým rozdílem mezi CRISPR a restrikčními enzymy je, že CRISPR je přirozeně se vyskytující prokaryotický imunitní obranný mechanismus, který byl nedávno použit pro editaci a modifikaci eukaryotických genů, zatímco restrikční enzymy jsou biologické nůžky, které štěpí molekuly DNA na menší látky.
Úpravy genomu a modifikace genů jsou zajímavé a inovativní oblasti v genetice a molekulární biologii. Studie genové terapie široce používají modifikaci genů. Kromě toho je modifikace genu užitečná při identifikaci vlastností genu, funkčnosti genu a toho, jak by mutace v genu mohly ovlivnit jeho funkci. Je důležité odvodit účinné a spolehlivé způsoby, jak provést přesné a cílené změny v genomu živých buněk. CRISPR a restrikční enzymy hrají klíčovou roli v genových modifikacích. CRISPR modifikuje geny s vysokou přesností. Restrikční enzymy fungují jako biologické nůžky, které štěpí molekuly DNA na menší látky.