Klíčový rozdíl - metabolomika vs. metabonomika
Metabolity jsou malé molekuly zapojené do metabolických reakcí v buňkách. Metabolity zahrnují metabolické meziprodukty, hormony, sekundární metabolity, signální molekuly atd. Jedná se o fungující molekuly biochemických reakcí buněk. Úplná sada metabolitů biologického vzorku nebo jediného organismu je známá jako metabolome. Metabolome je dynamická kolekce, která se mění každou sekundu v těle. Metabolomika a metabonomika jsou dva pojmy související se studiem metabolomu organismu. Klíčový rozdíl mezi metabolomikou a metabonomikou je v tom, že metabolomika se více zajímá o normální endogenní metabolismus a metabolické profilování na buněčné nebo orgánové úrovni, zatímco metabonomika se více zabývá rozšířením metabolického profilování s informacemi o narušení metabolismu vlivem faktorů prostředí, nemocí, střeva mikroorganismy a srovnávání metabolického profilování atd. Metabolomika je poháněna hlavně hmotnostní spektrometrií a metabonomika využívá pro analýzu metabolitů NMR spektroskopii.
OBSAH
1. Přehled a klíčový rozdíl
2. Co je metabolomika
3. Co je metabonomika
4. Porovnání vedle sebe - metabolomika vs. metabonomika
5. Shrnutí
Co je metabolomika?
Metabolomika je studium metabolických procesů, ke kterým dochází v buňkách, biofluidech, tkáních nebo organismech. Zahrnuje identifikaci a kvantifikaci buněčných metabolitů pomocí dobrých analytických a statistických nástrojů. Metabolomika je považována za důležitou studii, protože odhaluje informace o metabolismu organismu.
Ke studiu substrátů a produktů metabolických reakcí používá metabolomika jako analytickou platformu hmotnostní spektrometrii. Hmotnostní spektrometrie odhaluje typy metabolitů a jejich koncentrace odrážející skutečný biochemický stav buněk nebo tkání. Proto lze metabolomiku považovat za nejlepšího zástupce molekulárního fenotypu organismu. Metabolomics je omická technologie malých molekul organismů a ve srovnání s jinými studiemi omic; metabolomika je velmi důležitá, protože přímo odráží aktuální stav biochemické reakce buněk.
Metabolomika lze také považovat za rozšíření proteomiky, protože jsou vytvářeny v důsledku aktivit enzymů, kterými jsou proteiny, jak je znázorněno na následujícím obrázku.
Obrázek 01: Schéma metabolomiky
Co je metabonomika?
Metabonomika je definována jako kvantitativní měření multiparametrických metabolických odpovědí ve specifických dobách ve vztahu k patofyziologickým stresům nebo genetickým modifikacím. To se obvykle vztahuje na studie provedené o lidské výživě a reakcích na léky nebo nemoci. Tento přístup byl průkopníkem Jeremy Nicholsona na Imperial College v Londýně a byl použit v mnoha oblastech, včetně toxikologie, diagnostiky nemocí, výživy atd. Historicky byla metabonomika jednou z prvních metod, jak aplikovat rozsah systémové biologie na studie metabolismu.
Metabonomics se spíše zabývá spíše srovnáváním biochemických profilů než identifikací jednotlivých metabolických sloučenin v metabolomiku. Metabonomiku lze proto definovat jako podmnožinu metabolomiky. Zdůrazňuje zejména srovnání metabolických profilů různých populací s ohledem na nemoci, stresy prostředí, genetické modifikace, výživa, léky atd., Protože metabolity jsou dobrými markery, které signalizují chorobné stavy, účinky drog, stresy prostředí, vystavení toxinům, atd.
Metabonomické studie odhalují intracelulární i extracelulární metabolity. Využívá techniky s vysokou propustností k analýze obrovského počtu metabolitů současně a opakovaně, což umožňuje časové zkoumání fyziologického stavu buněk. Odhaluje také korelaci mezi metabolity a patologickým stavem organismu. Na podporu metabonomických studií lze použít genomiku a proteomiku, protože jsou vzájemně propojeny, jak je znázorněno na obrázku výše.
Jaký je rozdíl mezi metabonomikou a metabonomikou?
Rozdílný článek uprostřed před tabulkou
Metabolomika vs. metabonomika |
|
| Metabolomika je studium kompletní sady metabolitů organismu | Metabonomika je kvantitativní studie multiparametrických metabolických reakcí živých systémů v časové základně na patofyziologické podněty nebo genetické modifikace. |
| Hlavní obava | |
| Metabolomics se více zabývá metabolickým profilem a identifikací jednotlivých metabolitů přítomných v buňkách. | Metabonomics se více zabývá srovnáváním metabolitů nebo metabolických profilů populací ve vztahu ke genetickým modifikacím, chorobám, environmentálním stresům, patologickým podnětům, drogám atd. |
| Informace | |
| Metabolomika je zaměřena hlavně na endogenní metabolismus. | Metabonomika se neomezuje pouze na endogenní metabolismus. Rozšiřuje se o informace o poruchách metabolismu způsobených vnitřními a vnějšími faktory, jako jsou stravovací návyky, toxiny, chorobné procesy atd. |
| Analytické nástroje | |
| Používá hmotnostní spektrometrii jako hlavní analytickou platformu | Metabonomics používá NMR spektroskopii jako hlavní analytickou platformu. |
Shrnutí - Metabolomika vs. metabonomika
Metabolome představuje úplnou sadu malých molekul nazývaných metabolity přítomných v buňce nebo v organismu. Metabolomika je studium celého metabolomu za účelem vytvoření metabolického profilu. Metabolomika umožňuje vědcům měřit skutečný fyziologický stav buňky nebo organismu. Metabonomika je součástí metabolomiky, která se rozšiřuje o získání informací o multiparametrických metabolických reakcích živých systémů na patofyziologické podněty a genetické modifikace. Metabonomics se netýká pouze individuálního metabolického profilování, jako je metabolomika; srovnává metabolické profily ve vztahu k dalším faktorům, jako jsou environmentální stresy, nemoci, toxiny atd. Metabolomika i metabonomika zahrnují studie metabolitů organismů k měření skutečného fyziologického stavu buněk. Proto,někdy jsou tito dva považováni za synonyma, aniž by zohledňovali rozdíl mezi metabolomikou a metabonomikou.
