Klíčovým rozdílem mezi alelou a lokusem je, že alela odkazuje na jednu ze dvou nebo více alternativních sekvencí genu v určitém lokusu, zatímco lokus odkazuje na určité místo na chromozomu, kde lze gen najít.
Ve formě genů zdědí genetická informace od rodičů potomky. Geny jsou specifické nukleotidové sekvence umístěné v chromozomech. V genomu organismu lze nalézt mnoho genů. Jejich uspořádání v genomu je přesné a umístění genu lze snadno zjistit pomocí genetického markeru. Konkrétní gen může dále mít různé verze, které pojmenujeme jako alely. Specifické umístění genu v chromozomu je také velmi důležité a říkáme mu lokus.
