Klíčovým rozdílem mezi glukogenními a ketogenními aminokyselinami je to, že glukogenní aminokyseliny produkují během katabolismu pyruvát nebo jiné prekurzory glukózy, zatímco ketogenní aminokyseliny produkují během svého katabolismu acetyl CoA a acetoacetyl CoA.
Aminokyseliny jsou základní molekuly, které tvoří chemickou strukturu proteinů a polypeptidů. Ačkoli existují různé klasifikace aminokyselin, můžeme je klasifikovat jako glukogenní a ketogenní aminokyseliny v závislosti na meziproduktech, které tvoří během svého katabolismu. Jak bylo uvedeno výše, konečný produkt katabolismu aminokyselin poskytuje dva typy meziproduktů; buď pyruvát (nebo k jiným prekurzorům glukózy) nebo acetyl CoA a acetoacetyl CoA.
