Klíčovým rozdílem mezi fukoidanem a fukoxantinem je, že fukoidan je sulfatovaný polysacharid obsahující fukózu přítomný v různých druzích hnědých řas a hnědých mořských řas, zatímco fukoxanthin je xantofyl přítomný jako doplňkový pigment v chloroplastech hnědých řas a dalších heterokontech.
Mořské ekosystémy tvoří flóru i faunu. Mají vysokou rozmanitost druhů. Kromě toho tyto druhy obsahují různé sloučeniny, které jsou prospěšné pro člověka. Biomolekuly extrahované z těchto druhů v mořských ekosystémech obsahují různé terapeutické potenciály. Fucoidan a fucoxanthin jsou dvě takové sloučeniny přítomné v mořských ekosystémech, zejména v hnědých řasách. I když se chemicky liší, obě sloučeniny se v současné době používají pro různé výzkumné účely k identifikaci jejich potenciálu jako terapeutik.