Klíčovým rozdílem mezi fagocytózou a pinocytózou je, že fagocytóza je forma endocytózy, která absorbuje pevné látky přes plazmatickou membránu do buňky, zatímco pinocytóza je další formou endocytózy, která absorbuje tekutiny včetně solutů a malých molekul přes plazmatickou membránu do buňky.
Endocytóza je mechanismus, kterým buňky přijímají makromolekuly a další suspendované částice včetně buněčných částí, makromolekulárních agregátů a cizích částic do buňky. Exocytóza je opačný mechanismus endocytózy, kterým buňky vylučují látky z buněk. Exocytóza probíhá hlavně v sekrečních buňkách. Existují dva typy endocytózy založené na povaze částic, které jsou přijímány do živých buněk. Jsou to fagocytóza a pinocytóza. Mechanismus použitý v obou procesech je stejný. Tvoří vezikuly obklopující materiály, aby je vzali dovnitř. Oba procesy jsou aktivní procesy. Proto můžete pozorovat mitochondrie poblíž povrchů, kde k těmto procesům dochází.