Klíčový rozdíl mezi fagocytózou a opsonizací spočívá v tom, že fagocytóza je mechanismus prováděný určitými buňkami nebo organismy, který pohlcuje nebo pohlcuje cizí částice, zatímco opsonizace je proces, při kterém jsou patogeny odstraněny ze systému poté, co jsou označeny pomocí opsoninů.
Imunologické reakce mohou být vrozené nebo adaptivní. Patogeny mají receptory pro rozpoznávání patogenů, které usnadňují identifikaci hostitele. Opsonizace a fagocytóza jsou dvě imunologické odpovědi. Při opsonizaci hostitel identifikuje a označí invazní částice ke zničení produkcí opsoninů. Fagocytóza je mechanismus, kterým určité imunitní buňky pohlcují a ničí napadající částice nebo cizí částice z těla.
