Klíčovým rozdílem mezi glutaminem a L-glutaminem je, že glutamin je aminokyselina, zatímco L-glutamin je izomer glutaminu.
Aminokyselina je jednoduchá molekula vytvořená s C, H, O, N a možná S. Všechny aminokyseliny mají skupiny –COOH, -NH2 a –H vázané na uhlík. Skupina R se však liší od aminokyseliny k aminokyselině. V nejjednodušší aminokyselině je skupina R atom vodíku; říkáme tomu glycin. Existuje asi 20 běžných aminokyselin. Některé z nich jsou pro nás nezbytné, zatímco jiné nejsou podstatné. Glutamin je jednou z hlavních neesenciálních aminokyselin.