Klíčovým rozdílem mezi hematoencefalickou bariérou a hematoencefalickou bariérou je to, že hematoencefalická bariéra je bariéra, která odděluje krevní tkáň a mozkovou tkáň, zatímco hematoencefalická bariéra je funkční bariérou, která odděluje krevní tkáň a mozkomíšní mok.
Krevní mozková bariéra a krevní CSF bariéra jsou dvě ochranné bariéry v mozku. Jsou také důležité při transportu molekul přes mozek a tkáně periferní krve. Kromě toho mají obě bariéry těsné spojení usnadňující přenos netoxických sloučenin do mozku.