Klíčovým rozdílem mezi pepsinem a reninem je, že pepsin, který je jedním z hlavních trávicích enzymů, je proteáza vylučovaná žaludkem, zatímco renin je enzym a také hormon produkovaný juxtaglomerulárními buňkami ledvin.
Proteázy jsou enzymy, které hydrolyzují peptidové vazby a štěpí proteiny na peptidy nebo aminokyseliny. Pepsin je proteáza přítomná v žaludeční šťávě. Je to jeden z hlavních trávicích enzymů, které štěpí bílkovinná jídla na peptidy a aminokyseliny. Na rozdíl od toho je renin enzym a aspartátová proteáza. Je to iniciativní enzym systému renin-angiotensin. Renin funguje jako hormon a pomáhá regulovat krevní tlak.