Klíčový rozdíl mezi mezidruhové a vnitrodruhové hybridizace je, že mezidruhové hybridizace nastává mezi dvěma propojenými jednotlivci, které patří do dvou různých druhů, přičemž dojde k vnitrodruhová hybridizace mezi geneticky odlišnými dvou jedinců stejného druhu.
Hybridizace je proces páření nebo křížení geneticky odlišených jedinců nebo skupin. Hlavním cílem hybridizace je kombinovat žádoucí geny přítomné v různých organismech. Kromě toho se hybridizace používá k produkci potomků čistokrevných plemen. Páření lze provádět mezi dvěma jedinci stejného druhu nebo mezi dvěma jedinci různých druhů. Na základě toho existují dva typy hybridizace: vnitrodruhová hybridizace a mezidruhová hybridizace.