Klíčovým rozdílem mezi metodou agarové jamky a metodou difúze disku je, že v metodě difúze agarové jamky je roztok extraktu naplněn do díry nebo jamky vytvořené na agarovém médiu, zatímco v metodě difúze agarového disku je disk filtračního papíru obsahující testovaný roztok položen na povrch agaru.
Mikroorganismy jsou původci mnoha chorob. Existují různá antimikrobiální činidla, která ničí mikroorganismy a inhibují nebo zastavují jejich růst. K detekci antimikrobiální aktivity jsou k dispozici různé metody screeningu a hodnocení. Mezi nimi jsou metody difúze agarových jamek a metody difúze agarových disků běžně používanými metodami v analýze in vitro, což jsou metody agarové difúze. Tyto metody jsou široce používány, protože nevyžadují specifikované vybavení a další hodnocení pro reprodukovatelnost a standardizaci. Obě metody závisí na difúzi antimikrobiálního činidla agarovým médiem.
