Rozdíl mezi Embden Meyerhof Pathway a Entner Doudoroff Pathway je ten, že Embden Meyerhof Pathway je klasická glykolýza, která u eukaryot a mnoha prokaryot přeměňuje glukózu na pyruvát. Entner Doudoroff Pathway je zároveň alternativní cestou glykolýzy u několika bakterií a převádí glukózu na pyruvát za účelem produkce ATP.
Glykolýza je první stupeň buněčného dýchání, který přeměňuje glukózu na pyruvát. Během glykolýzy dochází k řadě reakcí. Generuje také dvě molekuly ATP jako čistou produkci. Cesta Embden Meyerhof je synonymem glykolýzy. glykolýza probíhá u eukaryot a mnoha prokaryot a používají glukózu ke generování ATP. U některých prokaryot, zejména u určitých bakterií, však existuje alternativa pro glykolýzu. Tato cesta je známá jako Entner Doudoroff Pathway. Cesta Entner Doudoroff tedy nahrazuje klasickou glykolýzu u několika druhů bakterií.