Klíčový rozdíl mezi HPLC s reverzní fází a normální fází spočívá v tom, že HPLC s reverzní fází používá nepolární stacionární fázi a polární mobilní fázi, zatímco HPLC s normální fází používá polární stacionární fázi a méně polární mobilní fázi.
Normální fázová HPLC je nejstarší technikou HPLC, kterou Tswett použil při separacích rostlinných extraktů; použil křídu ve skleněném sloupci. Toto byl klasický způsob chromatografie, který vedl k pojmenování této metody jako „normální“. Na druhé straně HPLC s reverzní fází je opakem běžné techniky, kterou vědci vyvinuli v poslední době.
