Klíčovým rozdílem mezi tichou a neutrální mutací je, že tichá mutace je specifický typ neutrální mutace, který nemá pozorovatelný účinek na fenotyp organismu, zatímco neutrální mutace je změna sekvence DNA, která není ani prospěšná, ani škodlivá pro schopnost organismus k přežití a reprodukci.
Mutace je změna, ke které dochází v nukleotidové sekvenci DNA. Mutace může probíhat kvůli faktorům prostředí, jako je cigaretový kouř a UV světlo nebo kvůli virovým útokům, silným chemikáliím atd. Mutace v zárodečných buňkách procházejí do dalších generací, zatímco mutace v zárodečných buňkách (somatické mutace) neprojdou do dalších generací a ovlivní přežití jediného organismu. Tiché mutace nevedou ke změnám v aminokyselinové sekvenci kódovaného proteinu. Neutrální mutace nezpůsobují pozorovatelný účinek na fenotyp organismu.
