Klíčovým rozdílem mezi NMR a rentgenovou krystalografií je, že NMR je analytická technika používaná ke stanovení typu a počtu atomů v organické molekule, zatímco rentgenová krystalografie je analytická technika používaná ke stanovení atomové a molekulární struktury krystalu.
Termín NMR znamená nukleární magnetickou rezonanci. Tento termín spadá pod subtopickou spektroskopii v analytické chemii. Rentgenová krystalografie je na druhé straně typem krystalografické techniky, při které pro analýzu krystalů používáme rentgenový paprsek.