Klíčový rozdíl - zakořeněný vs. nekořenovaný fylogenetický strom
Fylogeneze je důležité pole, které zkoumá život na Zemi v čase. Odhaluje spojení mezi organismy s jejich předky a potomky. Vztahy mezi organismy jsou schematicky znázorněny různými stromovými reprezentacemi, jako je dendogram, kladogram, fenogram, fylogram atd. Fylogenetický strom je větvící se stromový diagram, který vysvětluje fylogenetické vztahy mezi organismy s velikostí evoluční vzdálenosti. Existují dva hlavní typy fylogenetických stromů známé jako zakořeněné a nezakořeněné. Klíčovým rozdílem mezi zakořeněným a nezakořeněným fylogenetickým stromem je, že zakořeněný strom vykazuje nejzákladnějšího předka stromu, zatímco nezakořeněný fylogenetický strom nevykazuje kořen předků.
OBSAH
1. Přehled a klíčový rozdíl
2. Co je zakořeněný fylogenetický strom
3. Co je zakořeněný fylogenetický strom
4. Porovnání vedle sebe - zakořeněný vs. nekořenovaný fylogenetický strom
5. Shrnutí
Co je zakořeněný fylogenetický strom?
Zakořeněný fylogenetický strom slouží jako užitečné schéma, které ukazuje vývojovou historii. Má bazální uzel, který se nazývá kořen a představuje společného předka všech skupin stromu. Kořen stromu je považován za nejstarší bod ve stromu, který představuje posledního společného předka všech skupin zahrnutých do stromu. Kořenový strom tedy ukazuje směr evolučního času. Z jediného druhu kořenového stromu lze běžného původu nebo předka druhu najít stopováním zpět k bazálnímu uzlu. Protože zakořeněný strom zobrazuje směr evolučního času, je snadné najít starší nebo novější skupiny, které má. Kořenový strom lze použít ke studiu celých skupin organismů. Přesné zakořenění fylogenetického stromu je důležitým a zásadním faktorem, protože nepřesné zakořenění může mít za následek nesprávné interpretace genetických změn mezi organismy a jejich směrovosti evoluce.
Obrázek 01: Zakořeněný fylogenetický strom
Co je nezakořeněný fylogenetický strom?
Nezakořeněný fylogenetický strom je fylogenetický diagram, kterému chybí společný předek nebo bazální uzel. Tento typ stromu nenaznačuje původ evoluce zájmových skupin. Zobrazuje pouze vztah mezi organismy bez ohledu na směr evoluční časové linie. Proto je obtížné studovat evoluční vztahy skupin s ohledem na čas pomocí nezakořeněného stromu.
Existují dva hlavní způsoby, jak zakořenit nezakořeněný fylogenetický strom. Oni jsou
Hledání skupiny - To vyžaduje předchozí znalosti o vztazích mezi taxony. Potom může být taxon, který leží mimo skupinu, použit jako outgroup k nakreslení zakořeněného fylogenetického stromu
Nalezení středového bodu nebo vzdálenosti - Střední bod nejvzdálenějších dvou taxonů ve stromu lze považovat za kořen fylogenetického stromu
Obrázek 02: Nezakořeněný fylogenetický strom
Jaký je rozdíl mezi kořenovým a nezakořeněným fylogenetickým stromem?
Rozdílný článek uprostřed před tabulkou
Zakořeněný vs. nekořenovaný fylogenetický strom |
|
| Zakořeněný fylogenetický strom je diagram, který ukazuje posledního společného předka skupin. | Nezakořeněný fylogenetický strom ukazuje vztahy mezi organismy, aniž by ukazoval společného předka. |
| Uzel | |
| Má uzel (root). | Nemá uzel. |
| Směr vývoje | |
| Má směr označující evoluční čas. | Nespecifikuje evoluční vztah. |
| Postoj k ostatním | |
| Strom umožňuje určit vztah mezi předky a potomky mezi skupinami. | Strom neumožňuje hovořit o vztahu předek - potomek. |
Shrnutí - zakořeněný vs. nezakořeněný fylogenetický strom
Fylogenetický strom představuje evoluční cesty a spojení mezi organismy pomocí rozvětvených stromových diagramů. Fylogenetické kmeny mohou být zakořeněny nebo odemčeny. Kořenový strom má uzel na základně, představující společného předka, který spojuje všechny zájmové skupiny. Nezakořeněný strom ukazuje vztahy mezi organismy. Nezobrazuje však společného předka, kterého sdílejí všechny skupiny. To je rozdíl mezi zakořeněným a nezakořeněným fylogenetickým stromem.
