Klíčovým rozdílem mezi geitonogamií a xenogamií je, že geitonogamií je přenos pylu na stigma jiné květiny stejné rostliny, zatímco xenogamie je přenos pylu na stigma jiné květiny, která patří ke geneticky odlišné rostlině. Geitonogamie je druh samoopylení, zatímco xenogamie je druh křížového opylování.
Angiospermy se spoléhají na opylování pro hnojení a produkci semen. Pyl z prašníků se během opylování přenáší do stigmatu pestíku. K opylování může dojít mezi samčími a samičími částmi stejné květiny nebo mezi dvěma květy stejné rostliny nebo mezi dvěma květy různých rostlin. Pokud dojde k opylování mezi dvěma květy stejné rostliny, je to známé jako geitonogamie, zatímco pokud se vyskytuje mezi dvěma květy různých rostlin, je to známé jako xenogamie.
