Klíčovým rozdílem mezi Iso a Sec v organické chemii je to, že termín iso používáme k pojmenování organické sloučeniny obsahující všechny atomy uhlíku kromě jednoho, který tvoří souvislý řetězec, zatímco termín sec používáme k identifikaci funkční skupiny, která je navázána na sekundární uhlík atom.
V organické chemii existuje mnoho předpon, které používáme k identifikaci skupin přítomných ve sloučeninách ak pojmenování organických molekul, abychom je od sebe odlišili. Lepší nomenklaturní systém navíc dokáže pojmenovat i velmi složitou molekulu. Příklad: Nomenklatura IUPAC je nejlepší nomenklaturní systém, který poskytuje každý a každý detail o struktuře chemické sloučeniny.