Klíčovým rozdílem mezi sekvenováním celého genomu a sekvenováním exomu je to, že sekvenování celého genomu sekvenuje celý genom organismu, zatímco sekvence exomu sekvenují pouze gen exomu nebo proteiny kódující organismus.
Sekvenování je technika, která určuje přesné pořadí nukleotidů v konkrétní molekule DNA. Odráží pouze správné pořadí čtyř základen; adenin (A), guanin (G), cytosin (C) a thymin (T) ve fragmentu DNA. Existuje několik metod sekvenování, jako je Sangerovo sekvenování, sekvenování nové generace atd. Sekvenování může podstoupit buď kompletní genom organismu (sekvenování celého genomu), nebo pouze geny kódující proteiny v genomu (sekvenování exomu).
