Klíčovým rozdílem mezi nukleotidem a nukleosidem je to, že nukleotid obsahuje fosfátovou skupinu, zatímco nukleosidu chybí fosfátová skupina.
Nukleosidy a nukleotidy jsou podobný typ molekul, které se liší mírnou strukturální změnou. Nukleotid i nukleosid jsou složeny ze dvou stejných složek; pentózový cukr a dusíkatá báze. Kromě toho má nukleotid jednu nebo více fosfátových skupin. Přidáním fosfátové skupiny tedy může být nukleosid přeměněn na nukleotid pomocí enzymů nazývaných kináza. Nukleotid je stavebním kamenem nukleových kyselin. Na druhé straně jsou nukleosidy dobrými protirakovinovými a antivirovými látkami.