Klíčovým rozdílem mezi DNA a chromozomy je organizace jejich struktury. DNA je dvouvláknový stočený polymer složený z deoxyribonukleotidů, zatímco chromozom je struktura podobná vláknu složená z molekul DNA těsně stočených s histonovými proteiny.
DNA a chromozomy jsou dvě různé úrovně strukturálních organizací genetického materiálu. DNA je jednodušší struktura složená z dvojité šroubovice nukleotidů. Naproti tomu chromozomy jsou složitá organizovaná struktura složená z bílkovin a DNA složených specifickým způsobem. Ačkoli se DNA a chromozom navzájem liší v organizaci struktur, oba hrají hlavní roli při určování fyzických a funkčních vlastností organismu na základě uloženého dědičného materiálu.