Klíčovým rozdílem mezi fotosyntézou a chemosyntézou je, že fotosyntéza je proces přeměny energie slunečního světla na uhlohydráty fotoautotrofy, zatímco chemosyntéza je proces přeměny chemické energie anorganických sloučenin nebo methanu na organické sloučeniny chemoautotrofy.
Fotosyntéza a chemosyntéza jsou dva důležité procesy, které živým organismům umožňují vyrábět pro ně potraviny. Fotosyntéza i chemosyntéza pomáhají udržovat živé organismy. Ačkoli oba procesy využívají CO 2 a produkují organické sloučeniny, liší se od několika charakteristik popsaných v článku. Jak názvy napovídají, fotka znamená sluneční světlo a chemo znamená chemickou látku. Proto sluneční světlo poskytuje energii fotosyntéze, zatímco chemická energie anorganických sloučenin dodává energii chemosyntéze.