Klíčovým rozdílem mezi vakuolami a vezikuly je to, že vakuoly jsou velké vaky vázané na membránu používané jako úložiště, zatímco vezikuly jsou malé vaky vázané na membránu používané jako úložiště a pro transport uvnitř eukaryotických buněk.
Buňka je jako vak s chemikáliemi, který je schopen přežít a replikovat se. Buněčná membrána odděluje vnitřek buňky od vnějšího prostředí ve zvířecích buňkách. Proto je v rostlinných buňkách buněčná stěna vnější hranicí, která odděluje vnitřek buňky od vnějšího prostředí. Buňka obecně obsahuje ve své cytoplazmě různé typy organel. Mezi tyto organely patří jádro, Golgiho aparát, mitochondrie, endoplazmatické retikulum, ribozomy, centrioly, vezikuly atd.