Klíčovým rozdílem mezi protoxylemem a metaxylemem je to, že protoxylem je první vytvořený primární xylem, který má menší buňky, zejména úzké cévy a tracheidy, zatímco metaxylem je později vytvořený primární xylem, který má větší buňky, zejména širší cévy a tracheidy.
Xylem je jedním ze dvou typů vaskulárních tkání v rostlinách. Xylem provádí vzestupné pohyby vody a minerálů z kořenů do ostatních částí rostliny. Jedná se o trubicovitou strukturu obsahující různé typy specializovaných buněk, včetně cévních prvků, tracheidů, parenchymu a vláken. Existují dva typy xylem jako primární xylem a sekundární xylem. Primární xylem se vyvíjí během primárního růstu. Primární xylem má dále dvě části: protoxylem a metaxylem. Jak protoxylem, tak metaxylem pocházejí z prokambia během primárního růstu. Protoxylem vzniká jako první a metaxylem vzniká po protoxylemu.