Klíčovým rozdílem mezi heterochromatinem a euchromatinem je to, že heterochromatin je vysoce zabalená forma chromatinu, která je obecně neaktivní, zatímco euchromatin je volně balená forma chromatinu, která je obecně aktivní.
Chromatin je struktura, která drží řetězec DNA chromozomu. Heterochromatin a euchromatin jsou dva hlavní typy chromatinu přítomné v buňkách. Z hlediska struktury a funkce je rozdíl mezi heterochromatinem a euchromatinem. Kromě toho se také liší od vlastností transkripce a replikace.
