Klíčovým rozdílem mezi karyotypem a idiogramem je, že karyotyp je skutečným obrazem celkových chromozomů buňky, zatímco idiogram je schematickým diagramem karyotypu, který ilustruje všechny mapy chromozomů.
Sada chromozomů představuje genom a genetickou informaci organismu. Každý chromozom má jedinečný tvar, velikost a soubor genů. Počet a fyzikální struktury chromozomů odhalují důležité informace týkající se organismu. Karyotypizace je technika prováděná k vyšetření kompletní sady chromozomů v buňce. Během tohoto testu se shromažďují a analyzují celkové chromozomy, aby se určilo, zda v chromozomech existují numerické nebo strukturní abnormality. Skutečný obrázek, který zobrazuje celkové chromozomy buňky, je karyotyp, zatímco schematický diagram celkových chromozomů buňky je idiogram. Oba jsou důležité v cytogenetických studiích.