Klíčovým rozdílem mezi twinningem umělých embryí a nukleárním přenosem somatických buněk je to, že twinning umělých embryí je technika, při které dochází k dělení oplodněného vajíčka na dvě geneticky identická embrya za podmínek in vitro, zatímco nukleární přenos somatických buněk je technikou, při které je jádro somatické buňky do enukleované vaječné buňky probíhá za podmínek in vitro.
Molekulární klonování je důležitou technikou při výrobě rekombinantních organismů se zlepšenými znaky. Umělé partnerství embryí a jaderný přenos somatických buněk jsou dvě takové techniky používané v podmínkách in vitro za účelem vytváření klonů pro reprodukční i terapeutické účely. Existuje však rozdíl mezi twinningem umělých embryí a jaderným přenosem somatických buněk z hlediska jejich metody klonování.
