Klíčovým rozdílem mezi iontovou dvojicí a iontoměničovou chromatografií je to, že v iontové párové chromatografii mohou být ionty ve vzorku „spárovány“a odděleny jako iontový pár, zatímco v ionexové chromatografii mohou být ionty ve vzorku odděleny jako kationty a anionty samostatně.
Chromatografie je důležitá technika, která vede k oddělení různých složek ve směsi. Iontový pár a iontoměničová chromatografie jsou analytické techniky, které můžeme použít k oddělení iontů a polárních molekul ve směsi na základě elektrického náboje, který s sebou nesou.