Klíčový rozdíl - eukaryotičtí vs. prokaryotičtí promotéři
Transkripce je proces převodu genetické informace uložené v kódující sekvenci DNA na sekvenci mRNA. Tento proces iniciuje specifická oblast DNA umístěná na 5 'konci transkripční jednotky. Tato oblast je známá jako promotorová oblast. Tyto promotory se obvykle nacházejí v sousedství startovacího místa transkripce. Délka promotoru se pohybuje od 100 bp do 1000 bp. Pořadatelé se liší podle typu organismu. Eukaryotické a prokaryotické promotory se navzájem liší. U prokaryot se nacházejí pouze tři typy promotorových sekvencí, konkrétně -10 promotory, -35 promotor a upstream prvky. U eukaryot existuje mnoho různých promotorových prvků, jako je TATA box, iniciátorové prvky, GC box, CAAT box atd. To je klíčový rozdíl mezi eukaryotickými a prokaryotickými promotory.
OBSAH
1. Přehled a klíčový rozdíl
2. Co jsou eukaryotické promotory
3. Co jsou prokaryotické promotory
4. Podobnosti mezi eukaryotickými a prokaryotickými promotory
5. Srovnání vedle sebe - eukaryotické vs. prokaryotické promotory v tabulce
6. Souhrn
Co jsou eukaryotické promotéry?
Tři hlavní porce; základní promotor, proximální promotor a distální promotor, společně tvoří promotor. V kontextu eukaryot existuje mnoho počtů promotorových prvků, které jsou vysoce sofistikované a rozmanitější než promotory. Bylo zjištěno, že díky této složitosti eukaryotických promotorů má DNA schopnost složit se zpět na sebe. To také vysvětluje skutečnost, že dochází k účinku mnoha regulačních sekvencí, i když jsou umístěny mnoho kilobází od místa transkripce. Tyto eukaryotické promotory mají schopnost překlenout širokou škálu DNA sekvencí.
Obrázek 01: Eukaryotický promotér
Příklady některých eukaryotických promotorů jsou Pribnow box (TATA box), GC box, CAAT box atd. V kontextu TATA boxu je to sekvence 5 '- TATAA -3', která je přítomna v oblasti hlavního promotoru. K poli TATA jsou navázány proteiny transkripčního faktoru a proteiny histonu. Vazba proteinů transkripčního faktoru na TATA box napomáhá navázání RNA polymerázy, což pak vede k tvorbě transkripčního komplexu. Jednoduše řečeno, vazba těchto proteinů bude řídit proces transkripce. Tento proces bude inhibován, když se histonové proteiny naváží na TATA box. Proto je TATA box důležitým promotorovým prvkem, který zahrnuje regulaci rychlosti eukaryotické transkripce.
Co jsou prokaryotické promotéry?
V prokaryotických organismech je promotor, který se účastní transkripce, identifikován přidruženým faktorem nazývaným faktor sigma. Sigma faktory jsou jedinečné pro různé promotorové sekvence. Proto se říká, že každý jednotlivý faktor sigma by rozpoznal jedinou základní promotorovou sekvenci. Toto je jedinečná charakteristika, která je přítomna v procesu prokaryotického transkripce. Jak RNA polymeráza, tak sigma faktor společně identifikují správnou promotorovou oblast a tvoří transkripční komplex.
Prokaryotický promotor obsahuje pouze tři typy promotorových prvků. Menší zapojení promotorových prvků do prokaryot je hlavním důvodem, proč je jejich transkripční proces méně sofistikovaný ve srovnání s eukaryotickou transkripcí, která zahrnuje vyšší počet promotorových sekvencí. Ze tří promotorových prvků prokaryot existují dvě hlavní důležité dvě krátké sekvence DNA. Tyto sekvence jsou klasifikovány podle jejich umístění. Jsou to -10 promotory nebo prvek (který je přítomen 10 bp před místem zahájení transkripce), -35 promotory nebo prvek (který je přítomen 35 bp před místem zahájení transkripce).
Obrázek 02: Prokaryotický promotér
Promotor -10 je ekvivalentní s eukaryotickým TATA boxem nebo Pribnowovým boxem a je nezbytnou složkou pro zahájení transkripce u prokaryot. Promotor -35 sestává ze sekvence, kterou je TTGACA, která se aktivně podílí na regulaci rychlosti prokaryotické transkripce.
Jaké jsou podobnosti mezi eukaryotickými a prokaryotickými promotéry?
- U obou typů jsou promotory řízeny různými regulačními sekvencemi DNA, které zahrnují zesilovače, tlumiče, izolátory a hraniční prvky.
- Promotory jsou sekvence, které iniciují transkripci u prokaryot a eukaryot.
- Promotory jsou sekvence DNA.
Jaký je rozdíl mezi eukaryotickými a prokaryotickými promotory?
Rozdílný článek uprostřed před tabulkou
Eukaryotičtí a prokaryotičtí promotéři |
|
| Eukaryotické promotory jsou regulační sekvence, které iniciují transkripci eukaryotických organismů. | Prokaryotické promotory jsou regulační sekvence, které iniciují transkripci prokaryotických genů. |
| Elementy | |
| Prokaryotický promotor se skládá z upstream prvků, -10 prvků a -35 prvků. | Eukaryotický promotor se skládá z Pribnow boxu (TATA box), CAAT boxu, GC boxu a iniciátorových prvků. |
Shrnutí - Eukaryotický vs Prokaryotický promotér
Promotor je oblast DNA, která zahrnuje zahájení procesu zvaného transkripce. Tyto promotory se obvykle nacházejí proti proudu od místa zahájení transkripce. Tři hlavní části, které tvoří promotor, jsou jádrový promotor, proximální promotor a distální promotor. V kontextu eukaryot existuje v promotorové oblasti mnoho počtů propagačních prvků, které jsou vysoce propracované a rozmanitější než prokaryoty. Příklady některých eukaryotických promotorových elementů jsou Pribnow box (TATA box), GC box, CAAT box atd. U prokaryot existují dva hlavní důležité promotorové elementy, jmenovitě -10 element (který je přítomen 10bp upstream od místa startu transkripce), -35 elementů (to je přítomno 35 bp před místem zahájení transkripce). Promotor -10 iniciuje transkripci a promotor -35 reguluje transkripci. Oba typy promotorů jsou řízeny různými regulačními sekvencemi DNA, které zahrnují zesilovače, tlumiče, izolátory a hraniční prvky. To je rozdíl mezi eukaryotickými a prokaryotickými promotory.
Stáhněte si PDF eukaryotických vs prokaryotických promotérů
Můžete si stáhnout PDF verzi tohoto článku a použít ji pro offline účely podle citace. Stáhněte si verzi PDF zde: Rozdíl mezi eukaryotickým a prokaryotickým promotorem
