Klíčovým rozdílem mezi prokaryotickými a eukaryotickými ribozomy je, že prokaryotické ribozomy jsou 70S částice složené z 50S velké podjednotky a 30S malé podjednotky, zatímco eukaryotické ribozomy jsou 80S částice složené z 60S velké podjednotky a 40S malé podjednotky.
Prokaryoty a eukaryoty jsou dvě hlavní skupiny živých organismů, které se liší od buněčné organizace. Prokaryoty neobsahují buněčné organely vázané na jádro a membránu. Na druhou stranu eukaryota vlastní buněčné organely vázané na jádro a membránu. Existují některé organely společné pro oba organismy. Ribozom je jednou z důležitých a životně důležitých organel přítomných jak v prokaryotických, tak v eukaryotických buňkách. Jsou přítomny v cytoplazmě každé buňky. Strukturálně tvoří bílkoviny a ribozomální RNA (rRNA) ribozomy dohromady. A skládají se ze dvou podjednotek, jmenovitě větší podjednotky a malé podjednotky. Rovněž provádějí stejnou funkci, kterou je překlad molekul mRNA do proteinů. Protože překlad je životně důležitým procesem pro všechny živé organismy a vyskytuje se v ribozomech,ribozomy jsou velmi důležité jak pro prokaryoty, tak pro eukaryoty. Navzdory mnoha podobnostem existují určité rozdíly mezi prokaryotickými a eukaryotickými ribozomy.