Klíčovým rozdílem mezi polymerem a makromolekulou je, že polymer je makromolekula s opakující se jednotkou zvanou monomer v celé molekulární struktuře, zatímco ne každá makromolekula má ve své struktuře monomer.
Rozdíl mezi polymerem a makromolekulou vyplývá ze skutečnosti, že polymer je podskupinou makromolekuly. Makromolekuly jsou extrémně velké molekuly s vysokou molekulovou hmotností. Rovněž můžeme rozdělit makromolekulu do dvou hlavních kategorií podle její struktury. Jmenovitě se jedná o polymerované molekuly a nepolymerizované molekuly. Na druhou stranu se polymer tvoří z polymerace malých molekul, kterými jsou monomery. Ale všechny makromolekuly neobsahují monomerní jednotku opakující se v celé své struktuře.