Klíčový rozdíl mezi borazinem a benzenem spočívá v tom, že borazin obsahuje tři atomy boru a tři atomy dusíku v kruhové struktuře, zatímco benzen obsahuje šest atomů uhlíku v kruhové struktuře.
Borazin i benzen mají podobné struktury se šestičlenným kruhem a tyto dvě sloučeniny jsou izoelektronické. To znamená, že borazin i benzen mají stejný počet elektronů nebo stejnou elektronovou strukturu. Mají však zcela odlišné chemické a fyzikální vlastnosti, protože kruhy těchto sloučenin se skládají z různých atomů.