Klíčovým rozdílem mezi genomem a genovým fondem je, že genom odkazuje na celou DNA organismu, zatímco genový fond odkazuje na kompletní sadu jedinečných genů populace křížení.
Gen je základní strukturální jednotkou dědičnosti. Geny přecházejí z rodičů na potomky prostřednictvím gamet. Jsou také přítomny v genomu organismu. Genom je kompletní sada DNA organismu. Genofond je také podobný termín. Představuje však soubor všech genů přítomných v populaci nebo druhu. Na rozdíl od genomu je genofond směsí genů populace. Genofond tedy představuje všechny možné alely přítomné v dané konkrétní populaci.