Klíčovým rozdílem mezi somatickou variací a germinální variací je to, že somatická variace je genetická variace vyskytující se v somatických buňkách, zatímco germinální variace je genetická variace vyskytující se v zárodečných buňkách, jako jsou vajíčka nebo spermie.
Genetická variace se týká procesu změny genetického materiálu organismu nebo rozdílu v sekvencích DNA mezi jednotlivci v populaci. Sekvence DNA podléhají změnám v čase z generace na generaci. Genetická rekombinace je jedním z hlavních mechanismů, které způsobují genetické variace. Mutace může také způsobit genetickou variabilitu. Geneticky mají mnohobuněčné organismy dva hlavní typy buněk; somatické buňky a zárodečné buňky. Genetická variace je tedy dvou typů; jsou to somatické variace a germinální variace. Pokud se genetická variace vyskytuje v somatických buňkách, nazýváme ji somatickou variací a pokud se genetická variace vyskytuje v zárodečných buňkách, nazýváme ji germinální variací. Somatické variace jsou většinou nedědičné, zatímco germinální variace jsou většinou dědičné.