Klíčový rozdíl mezi spirálou alfa a beta závisí na typu vodíkové vazby, kterou tvoří při vývoji těchto struktur. Alfa helixy tvoří nitromolekulární vodíkové vazby, zatímco beta helixy tvoří mezimolekulární vodíkové vazby.
Komplexní proteiny mají čtyři strukturální organizační úrovně - primární, sekundární, terciární a kvartérní. Sekundární struktury proteinů tvoří peptidové řetězce v různých orientacích. Peptidové řetězce se skládají z aminokyselinových sekvencí vázaných peptidovými vazbami. Proto v proteinech existují dvě hlavní sekundární struktury jako alfa šroubovice a beta šroubovice. Kromě toho existují další sekundární struktury zvané beta turn a vlásenky. Tento článek se zaměřuje hlavně na rozdíl mezi spirálou alfa a beta.
