Klíčovým rozdílem mezi hybridy DNA-RNA a dsDNA je, že hybridy DNA-RNA jsou dvouvláknové nukleotidy složené z jednoho řetězce DNA a jednoho doplňkového řetězce RNA, zatímco dsDNA je dvouřetězcová DNA složená ze dvou komplementárních řetězců DNA.
V původním stavu je DNA dvouvláknová. Má dva komplementární řetězce DNA vázané vodíkovými vazbami. RNA je ve své přirozené struktuře jednovláknová. V některých případech tvoří RNA duplexy s DNA. Jsou známy jako hybridy DNA-RNA. Vznikají hlavně během transkripce a množení onkogenních RNA virů. Ve srovnání s dsDNA jsou hybridy DNA-RNA stabilnější.
