Klíčovým rozdílem mezi klasickou a moderní genetikou je, že klasickou genetikou je mendelovská genetika nebo starší koncept genetiky, který se vyjadřuje pouze na základě fenotypů vycházejících z šlechtitelských experimentů, zatímco moderní genetika je nový koncept genetiky, který umožňuje přímé zkoumání genotypů spolu s fenotypy.
Velký vědec Gregor Mendel je otcem genetiky. Mendel představil několik zákonů týkajících se dědičnosti vlastností a způsobu, jakým tyto vlastnosti přecházejí z rodiče na potomky. Jeho nálezy se tak staly základem zcela nového konceptu objeveného později v genetice. Klasická genetika a moderní genetika jsou tedy dva odlišné pojmy. Klasická genetika je však základem moderní genetiky.
