Klíčový rozdíl mezi Mollusca a Echinodermata závisí na stanovišti organismů patřících do těchto dvou tříd. Měkkýši žijí v suchozemském i vodním prostředí, zatímco ostnokožci žijí striktně v mořském prostředí.
Kmen měkkýšů a kmen Echinodermata patří do říše Animalia. Z hlediska morfologických, fyziologických a behaviorálních charakteristik existuje mezi měkkýši a ostnokožci. Měkkýši i ostnokožci jsou však triploblastickí a mají kompletní trávicí systém. Biologové a taxonomové studují vlastnosti organismů každého kmene, aby je mohli účinně kategorizovat.