Klíčovým rozdílem mezi molekulární orbitální teorií a hybridizační teorií je, že molekulární orbitální teorie popisuje vznik vazebných a anti-vazebných orbitálů, zatímco hybridizační teorie popisuje vznik hybridních orbitálů.
Existují různé teorie vyvinuté k určení elektronických a orbitálních struktur molekul. Teorie VSEPR, teorie Lewise, teorie valenčních vazeb, teorie hybridizace a teorie molekulárních orbitů jsou tak důležité teorie. Nejpřijatelnější teorií mezi nimi je molekulární orbitální teorie.
