Klíčovým rozdílem mezi mykoplazmou a chlamydií je, že mykoplazma je rod bakterií, který postrádá buněčnou stěnu, zatímco chlamydie je rod bakterií, který zahrnuje gramnegativní a obligátní parazity.
Druhy Mycoplasma jsou nejmenší bakterie, které byly dosud objeveny, s nejmenšími genomy a minimálním počtem vysoce esenciálních organel. Mykoplazma je bakterie bez stěny. Proto nemají určitý tvar. Obecně jsou to sférické až vláknité buňky. Naproti tomu chlamydie je rod bakterií, který má buněčné stěny. Jsou to gramnegativní bakterie. Mykoplazma i chlamydie způsobují pohlavně přenosné choroby. Kromě toho vyvolávají podobné příznaky, ale lze je léčit různými antibiotiky.
