Klíčový rozdíl mezi těly Golgi a mitochondriemi spočívá v jejich funkci. Hlavní funkcí Golgiho těl (nebo Golgiho aparátu) je modifikace, třídění a balení proteinů pro sekreci, zatímco hlavní funkcí mitochondrií je produkce energetické měny buňky (ATP) prostřednictvím dýchání.
Eukaryotické buňky obsahují buněčné organely, jako jsou Golgiho těla, mitochondrie, lysosomy, ribozomy, jádro atd. Jedná se o životně důležité organely nezbytné pro buněčné funkce. Golgiho těla jsou součástí endomembránového systému, který se skládá z vezikul a složených membrán, zatímco Mitochondrie jsou dvojité membránově vázané fazole ve tvaru organel nalezených v eukaryotických buňkách.