Klíčovým rozdílem mezi zatměním a latentním obdobím je to, že období zatmění je čas syntézy fágových proteinů a nukleových kyselin uvnitř hostitelské buňky, zatímco latentní období je čas mezi injekcí virového genomu do buňky a lýzou hostitelské buňky.
Bakteriofág (fág) je obligátní intracelulární virová částice, která infikuje a množí se v určité bakterii. Tito jsou také známí jako bakteriální jedlíci, protože působí jako baktericidní látky. Tvar hlavy a ocasu je nejběžnějším tvarem, který ukazují bakteriofágy. Infikují hostitelské bakterie, aby se mohly množit. Na začátku infekce se pomocí povrchových receptorů pevně připojí k bakteriální buněčné stěně a vstříknou svůj genetický materiál do hostitelské buňky. K jejich infekci pak může dojít prostřednictvím dvou cyklů: lytického a lysogenního cyklu.
V lytickém cyklu bakteriofágy infikují bakterie a rychle ničí hostitelskou bakteriální buňku lýzou. V lysogenním cyklu se virový genetický materiál integruje s bakteriálním genomem nebo plazmidy a existuje v hostitelské buňce po mnoho generací, aniž by zabil hostitelskou bakterii. Proces infekce následuje po různých obdobích, jako je latentní období, období zatmění, období vzestupu atd.
